BibTex RIS Kaynak Göster

Erzurum Bölgesinde Sığırlarda Respiratory Coronavirus Enfeksiyonunun RT-PCR ile tespiti ve Moleküler Karakterizasyonu

Yıl 2015, Cilt: 10 Sayı: 3, 0 - , 20.12.2015

Mehmet Timurkan Hakan Aydın Sema Belen

https://doi.org/10.17094/avbd.80527
Cited By: 3

Öz

Sığırların coronavirusları (BCoV) dünya genelinde sığırcılık işletmelerini etkileyerek ciddi solunum ve sindirim sistemi enfeksiyonlarına yol açmaktadır. Bu çalışmada, sığır yetiştiriciliği yapılan işletmelerinde coronavirusların varlığını/yaygınlığını göstermek ve tespit edilen virusların diğer coronaviruslarla ilişkisinin araştırılması amaçlanmıştır. Erzurum ili ve ilçelerinde solunum sistemi semptomları gösteren, farklı ırk ve yaş gruplarında 54 adet sığır çalışmaya dahil edildi. Materyal olarak hayvanlardan burun sıvabı ve mezbahada kesilen hayvanlardan pnömonili akciğer dokusu alındı. Toplanan örneklerde viral nükleik asit ekstraksiyonu, RT-PCR ve nested-PCR reaksiyonları gerçekleştirildi. Bölgeyi temsilen bir amplikon dizi analizine tabi tutuldu. Yöremize ait coronavirus suşu ile gen bankasından sağlanan aşı ve çeşitli coronavirus suşlarına ait nükleik asit dizilimi karşılaştırılarak karakterize edildi. Coronavirus yönünden yapılan moleküler incelemeler sonucunda solunum sistemi enfeksiyonu bulunan 54 sığırdan alınan akciğer doku ve sıvab örneğinin 11 (%20.4)’inde etken pozitif olarak belirlenmiştir. Ayrıca dizi analizi sonucu bölgede sirküle olan virusun Betacoronavirus A grubunda yer aldığı ve aşı suşuyla aynı clusterda yer aldığı tespit edilmiştir. Bu çalışma ile bölgemiz ve ülkemiz açısından mevcut durum güncellenerek epidemiyolojik verilere katkıda bulunulmuştur. 

Anahtar Kelimeler

-

Toplam 0 adet kaynakça vardır.

Ayrıntılar

Birincil Dil Türkçe
Bölüm Araştırma Makaleleri
Yazarlar

Mehmet Timurkan

Hakan Aydın Bu kişi benim

Sema Belen Bu kişi benim

Yayımlanma Tarihi 20 Aralık 2015
Yayımlandığı Sayı Yıl 2015 Cilt: 10 Sayı: 3

Kaynak Göster

APA Timurkan, M., Aydın, H., & Belen, S. (2015). Erzurum Bölgesinde Sığırlarda Respiratory Coronavirus Enfeksiyonunun RT-PCR ile tespiti ve Moleküler Karakterizasyonu. Atatürk Üniversitesi Veteriner Bilimleri Dergisi, 10(3). https://doi.org/10.17094/avbd.80527
AMA Timurkan M, Aydın H, Belen S. Erzurum Bölgesinde Sığırlarda Respiratory Coronavirus Enfeksiyonunun RT-PCR ile tespiti ve Moleküler Karakterizasyonu. Atatürk Üniversitesi Veteriner Bilimleri Dergisi. Aralık 2015;10(3). doi:10.17094/avbd.80527
Chicago Timurkan, Mehmet, Hakan Aydın, ve Sema Belen. “Erzurum Bölgesinde Sığırlarda Respiratory Coronavirus Enfeksiyonunun RT-PCR Ile Tespiti Ve Moleküler Karakterizasyonu”. Atatürk Üniversitesi Veteriner Bilimleri Dergisi 10, sy. 3 (Aralık 2015). https://doi.org/10.17094/avbd.80527.
EndNote Timurkan M, Aydın H, Belen S (01 Aralık 2015) Erzurum Bölgesinde Sığırlarda Respiratory Coronavirus Enfeksiyonunun RT-PCR ile tespiti ve Moleküler Karakterizasyonu. Atatürk Üniversitesi Veteriner Bilimleri Dergisi 10 3
IEEE M. Timurkan, H. Aydın, ve S. Belen, “Erzurum Bölgesinde Sığırlarda Respiratory Coronavirus Enfeksiyonunun RT-PCR ile tespiti ve Moleküler Karakterizasyonu”, Atatürk Üniversitesi Veteriner Bilimleri Dergisi, c. 10, sy. 3, 2015, doi: 10.17094/avbd.80527.
ISNAD Timurkan, Mehmet vd. “Erzurum Bölgesinde Sığırlarda Respiratory Coronavirus Enfeksiyonunun RT-PCR Ile Tespiti Ve Moleküler Karakterizasyonu”. Atatürk Üniversitesi Veteriner Bilimleri Dergisi 10/3 (Aralık 2015). https://doi.org/10.17094/avbd.80527.
JAMA Timurkan M, Aydın H, Belen S. Erzurum Bölgesinde Sığırlarda Respiratory Coronavirus Enfeksiyonunun RT-PCR ile tespiti ve Moleküler Karakterizasyonu. Atatürk Üniversitesi Veteriner Bilimleri Dergisi. 2015;10. doi:10.17094/avbd.80527.
MLA Timurkan, Mehmet vd. “Erzurum Bölgesinde Sığırlarda Respiratory Coronavirus Enfeksiyonunun RT-PCR Ile Tespiti Ve Moleküler Karakterizasyonu”. Atatürk Üniversitesi Veteriner Bilimleri Dergisi, c. 10, sy. 3, 2015, doi:10.17094/avbd.80527.
Vancouver Timurkan M, Aydın H, Belen S. Erzurum Bölgesinde Sığırlarda Respiratory Coronavirus Enfeksiyonunun RT-PCR ile tespiti ve Moleküler Karakterizasyonu. Atatürk Üniversitesi Veteriner Bilimleri Dergisi. 2015;10(3).

Cited By

Identification and molecular characterisation of bovine parainfluenza virus-3 and bovine respiratory syncytial virus - first report from Turkey
Journal of Veterinary Research
Mehmet Ozkan Timurkan
https://doi.org/10.2478/jvetres-2019-0022
Co-Infection of Bovine Papular Stomatitis Virus, Rotavirus and Cryptosporidium Spp. in a Calf
Acta Veterinaria
Eroksuz Yesari
https://doi.org/10.2478/acve-2020-0039
Buzağı İshallerinde Coronavirusun Nukleoprotein Gen ve Rotavirusun VP7/VP4 Gen Bölgelerinin Kısmi Sekansı ve Filogenetik Analizi
Atatürk Üniversitesi Veteriner Bilimleri Dergisi
Hakan AYDIN
https://doi.org/10.17094/ataunivbd.372439
 Kapak Resmi İndir